2013年，杭甬运河完成运量1776万吨，是年度计划1730万吨的102.7%，共安全运行1.6万闸次，通过各类船舶5.7万艘，稽征2500万元。

船闸营运克服汛期及台风停航、泥浆船骤减等客观因素，努力提高船舶周转率和过闸率，超额完成年度运量考核指标。全年通过的货物主要以黄沙、煤炭和石子为主，其中煤炭的通过量比往年稍有增长，其他货物通过量基本与往年持平。